Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC142Q17RM4 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
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