Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CNGA3Q16281 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CNGA3Q16281 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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CNGA3Q16281 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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