Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SF1Q15637 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SF1Q15637 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SF1Q15637 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SF1Q15637 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SF1Q15637 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SF1Q15637 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SF1Q15637 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SF1Q15637 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SF1Q15637 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF1Q15637 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF1Q15637 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF1Q15637 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF1Q15637 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF1Q15637 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF1Q15637 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF1Q15637 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SF1Q15637 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF1Q15637 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF1Q15637 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF1Q15637 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF1Q15637 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF1Q15637 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF1Q15637 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF1Q15637 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SF1Q15637 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SF1Q15637 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SF1Q15637 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SF1Q15637 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SF1Q15637 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SF1Q15637 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SF1Q15637 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF1Q15637 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF1Q15637 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF1Q15637 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF1Q15637 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF1Q15637 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SF1Q15637 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SF1Q15637 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SF1Q15637 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SF1Q15637 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SF1Q15637 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SF1Q15637 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SF1Q15637 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SF1Q15637 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SF1Q15637 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SF1Q15637 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SF1Q15637 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SF1Q15637 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SF1Q15637 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SF1Q15637 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SF1Q15637 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SF1Q15637 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SF1Q15637 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SF1Q15637 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SF1Q15637 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SF1Q15637 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SF1Q15637 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SF1Q15637 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SF1Q15637 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SF1Q15637 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SF1Q15637 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SF1Q15637 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SF1Q15637 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SF1Q15637 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SF1Q15637 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SF1Q15637 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SF1Q15637 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SF1Q15637 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SF1Q15637 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SF1Q15637 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SF1Q15637 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SF1Q15637 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SF1Q15637 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SF1Q15637 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SF1Q15637 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SF1Q15637 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SF1Q15637 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SF1Q15637 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SF1Q15637 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SF1Q15637 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SF1Q15637 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SF1Q15637 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SF1Q15637 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SF1Q15637 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SF1Q15637 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SF1Q15637 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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