Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SCN5AQ14524 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN5AQ14524 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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