Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
COL9A2Q14055 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
COL9A2Q14055 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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