Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
MSLNQ13421 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0□□□□□ -2.41
MSLNQ13421 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.6 ms