Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SEMA3FQ13275 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3FQ13275 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3FQ13275 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 346.9 ms