Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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TRAF1Q13077 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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TRAF1Q13077 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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TRAF1Q13077 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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TRAF1Q13077 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF1Q13077 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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TRAF1Q13077 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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TRAF1Q13077 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF1Q13077 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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