Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
STRN3Q13033 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
STRN3Q13033 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
STRN3Q13033 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
STRN3Q13033 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
STRN3Q13033 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
STRN3Q13033 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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