Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
FOXF1Q12946 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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FOXF1Q12946 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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FOXF1Q12946 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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FOXF1Q12946 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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