Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
FAM53CQ9NYF3 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FAM53CQ9NYF3 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FAM53CQ9NYF3 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM53CQ9NYF3 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM53CQ9NYF3 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM53CQ9NYF3 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM53CQ9NYF3 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM53CQ9NYF3 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM53CQ9NYF3 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FAM53CQ9NYF3 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM53CQ9NYF3 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
FAM53CQ9NYF3 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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