Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C17orf47Q8NEP4 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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C17orf47Q8NEP4 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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C17orf47Q8NEP4 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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C17orf47Q8NEP4 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
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C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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C17orf47Q8NEP4 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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C17orf47Q8NEP4 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C17orf47Q8NEP4 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C17orf47Q8NEP4 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C17orf47Q8NEP4 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C17orf47Q8NEP4 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C17orf47Q8NEP4 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C17orf47Q8NEP4 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C17orf47Q8NEP4 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
C17orf47Q8NEP4 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C17orf47Q8NEP4 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C17orf47Q8NEP4 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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