Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCDC142Q17RM4 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC142Q17RM4 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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