Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SMCO1Q147U7 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-2.75□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SMCO1Q147U7 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-2.79□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.8□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-2.81□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-2.81□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SMCO1Q147U7 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SMCO1Q147U7 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SMCO1Q147U7 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.7 ms