Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A2Q14055 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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