Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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SQSTM1Q13501 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SQSTM1Q13501 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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SQSTM1Q13501 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SQSTM1Q13501 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SQSTM1Q13501 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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SQSTM1Q13501 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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SQSTM1Q13501 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
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SQSTM1Q13501 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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