Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL49Q13405 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
MRPL49Q13405 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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