Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
TRIM28Q13263 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRIM28Q13263 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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