Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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FOXC1Q12948 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
FOXC1Q12948 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXC1Q12948 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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FOXC1Q12948 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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FOXC1Q12948 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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FOXC1Q12948 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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FOXC1Q12948 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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FOXC1Q12948 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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FOXC1Q12948 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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FOXC1Q12948 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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FOXC1Q12948 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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FOXC1Q12948 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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FOXC1Q12948 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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FOXC1Q12948 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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