Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RABGGTBP53611 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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