Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMPOP42166 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMPOP42166 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMPOP42166 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMPOP42166 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMPOP42166 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMPOP42166 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMPOP42166 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMPOP42166 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMPOP42166 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMPOP42166 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMPOP42166 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TMPOP42166 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMPOP42166 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMPOP42166 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMPOP42166 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMPOP42166 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMPOP42166 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMPOP42166 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMPOP42166 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TMPOP42166 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMPOP42166 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMPOP42166 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMPOP42166 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMPOP42166 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMPOP42166 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMPOP42166 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMPOP42166 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMPOP42166 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMPOP42166 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TMPOP42166 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TMPOP42166 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TMPOP42166 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMPOP42166 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMPOP42166 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMPOP42166 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMPOP42166 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TMPOP42166 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMPOP42166 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMPOP42166 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMPOP42166 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMPOP42166 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMPOP42166 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMPOP42166 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMPOP42166 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMPOP42166 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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