Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1Q9UJ41 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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