Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
PRRT1Q99946 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
PRRT1Q99946 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
PRRT1Q99946 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.7 ms