Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-2.71□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-2.71□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.74□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-2.75□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
UBR3Q6ZT12 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.2 ms