Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TPRNQ4KMQ1 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TPRNQ4KMQ1 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TPRNQ4KMQ1 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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