Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF260Q3ZCT1 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF260Q3ZCT1 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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