Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZNF239Q16600 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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