Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
UBE3CQ15386 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
UBE3CQ15386 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
UBE3CQ15386 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.1 ms