Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
RPA4Q13156 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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RPA4Q13156 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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RPA4Q13156 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RPA4Q13156 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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RPA4Q13156 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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RPA4Q13156 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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RPA4Q13156 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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RPA4Q13156 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RPA4Q13156 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
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