Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK3Q13003 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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GRIK3Q13003 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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GRIK3Q13003 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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GRIK3Q13003 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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GRIK3Q13003 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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GRIK3Q13003 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK3Q13003 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
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