Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRAPPC2LH3BP13 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRAPPC2LH3BP13 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRAPPC2LH3BP13 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRAPPC2LH3BP13 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRAPPC2LH3BP13 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRAPPC2LH3BP13 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRAPPC2LH3BP13 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179 ms