Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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SNX13Q9Y5W8 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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SNX13Q9Y5W8 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNX13Q9Y5W8 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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SNX13Q9Y5W8 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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SNX13Q9Y5W8 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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SNX13Q9Y5W8 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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SNX13Q9Y5W8 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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SNX13Q9Y5W8 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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SNX13Q9Y5W8 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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