Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SHOC2Q9UQ13 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SHOC2Q9UQ13 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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