Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SCN11AQ9UI33 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-2.55□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SCN11AQ9UI33 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
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