Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
BCANQ96GW7 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
BCANQ96GW7 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BCANQ96GW7 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BCANQ96GW7 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BCANQ96GW7 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BCANQ96GW7 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BCANQ96GW7 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BCANQ96GW7 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BCANQ96GW7 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BCANQ96GW7 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BCANQ96GW7 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BCANQ96GW7 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270.6 ms