Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATG4CQ96DT6 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATG4CQ96DT6 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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