Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SGCBQ16585 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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