Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
ZNHIT3Q15649 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZNHIT3Q15649 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZNHIT3Q15649 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZNHIT3Q15649 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ZNHIT3Q15649 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.6 ms