Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
EIF4EBP1Q13541 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
EIF4EBP1Q13541 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.3 ms