Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NR1H3Q13133 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NR1H3Q13133 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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