Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PKHD1P08F94 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PKHD1P08F94 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
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