Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRTO14522 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRTO14522 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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