Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SHOC2Q9UQ13 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHOC2Q9UQ13 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 286.9 ms