Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TMOD4Q9NZQ9 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TMOD4Q9NZQ9 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TMOD4Q9NZQ9 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TMOD4Q9NZQ9 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TMOD4Q9NZQ9 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TMOD4Q9NZQ9 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TMOD4Q9NZQ9 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TMOD4Q9NZQ9 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.2 ms