Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BCANQ96GW7 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BCANQ96GW7 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BCANQ96GW7 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BCANQ96GW7 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BCANQ96GW7 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BCANQ96GW7 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BCANQ96GW7 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BCANQ96GW7 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BCANQ96GW7 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BCANQ96GW7 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BCANQ96GW7 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
BCANQ96GW7 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
BCANQ96GW7 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
BCANQ96GW7 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BCANQ96GW7 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BCANQ96GW7 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BCANQ96GW7 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BCANQ96GW7 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
BCANQ96GW7 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
BCANQ96GW7 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
BCANQ96GW7 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
BCANQ96GW7 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BCANQ96GW7 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BCANQ96GW7 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BCANQ96GW7 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BCANQ96GW7 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
BCANQ96GW7 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BCANQ96GW7 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BCANQ96GW7 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.8 ms