Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATG4CQ96DT6 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 501.2 ms