Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC142Q17RM4 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC142Q17RM4 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC142Q17RM4 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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