Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SGCBQ16585 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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SGCBQ16585 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SGCBQ16585 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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