Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
DDB1Q16531 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
DDB1Q16531 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
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