Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SMC1AQ14683 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SMC1AQ14683 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.1 ms